Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnk2O54967 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnk2O54967 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnk2O54967 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnk2O54967 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnk2O54967 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnk2O54967 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnk2O54967 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnk2O54967 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnk2O54967 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnk2O54967 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms