Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms