Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DffaO54786 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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DffaO54786 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DffaO54786 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DffaO54786 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DffaO54786 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DffaO54786 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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DffaO54786 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DffaO54786 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DffaO54786 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DffaO54786 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DffaO54786 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DffaO54786 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DffaO54786 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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DffaO54786 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DffaO54786 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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DffaO54786 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DffaO54786 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DffaO54786 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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DffaO54786 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DffaO54786 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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DffaO54786 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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DffaO54786 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DffaO54786 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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DffaO54786 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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