Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FxnO35943 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FxnO35943 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FxnO35943 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FxnO35943 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FxnO35943 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FxnO35943 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FxnO35943 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FxnO35943 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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