Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pik3cdO35904 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms