Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms