Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms