Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms