Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm5294J3QP53 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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