Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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