Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms