Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3336J3QMQ6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3336J3QMQ6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3336J3QMQ6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3336J3QMQ6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3336J3QMQ6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3336J3QMQ6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3336J3QMQ6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3336J3QMQ6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3336J3QMQ6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3336J3QMQ6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3336J3QMQ6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3336J3QMQ6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms