Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms