Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm17535J3KMR8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm17535J3KMR8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms