Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r34G3XA52 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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