Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfgef1G3X9K3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms