Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Vmn1r167G3UW71 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Vmn1r167G3UW71 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Vmn1r167G3UW71 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Vmn1r167G3UW71 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Vmn1r167G3UW71 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Vmn1r167G3UW71 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Vmn1r167G3UW71 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Vmn1r167G3UW71 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Vmn1r167G3UW71 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Vmn1r167G3UW71 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Vmn1r167G3UW71 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r167G3UW71 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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