Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ms4a6c-201ENSMUST00000165310 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 L1cam-203ENSMUST00000114430 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Tomt-201ENSMUST00000106969 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms