Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmod3E9QA62 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms