Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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