Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ssxb8B1AY40 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ssxb8B1AY40 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ssxb8B1AY40 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ssxb8B1AY40 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ssxb8B1AY40 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ssxb8B1AY40 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ssxb8B1AY40 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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