Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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