Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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PtprsB0V2N1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms