Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms