Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Palm3A2TJV2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Palm3A2TJV2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms