Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn1aA2APX8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Scn1aA2APX8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Scn1aA2APX8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scn1aA2APX8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scn1aA2APX8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms