Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lcn6A2AJB9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lcn6A2AJB9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lcn6A2AJB9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lcn6A2AJB9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lcn6A2AJB9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lcn6A2AJB9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lcn6A2AJB9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lcn6A2AJB9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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