Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm12A2AJ77 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms