Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms