Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms