Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms