Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms