Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms