Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W8

Atp12a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp12aQ9Z1W8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Atp12aQ9Z1W8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atp12aQ9Z1W8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Atp12aQ9Z1W8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp12aQ9Z1W8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms