Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Snx1Q9WV80 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Snx1Q9WV80 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snx1Q9WV80 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snx1Q9WV80 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx1Q9WV80 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx1Q9WV80 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx1Q9WV80 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx1Q9WV80 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx1Q9WV80 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx1Q9WV80 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx1Q9WV80 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx1Q9WV80 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx1Q9WV80 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx1Q9WV80 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx1Q9WV80 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx1Q9WV80 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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