Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TapbpQ9R233 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TapbpQ9R233 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TapbpQ9R233 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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