Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms