Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms