Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gpc6Q9R087 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gpc6Q9R087 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gpc6Q9R087 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gpc6Q9R087 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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