Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms