Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms