Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms