Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms