Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms