Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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