Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms