Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms