Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trmt112Q9DCG9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trmt112Q9DCG9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms