Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GabarapQ9DCD6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GabarapQ9DCD6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GabarapQ9DCD6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GabarapQ9DCD6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GabarapQ9DCD6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GabarapQ9DCD6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GabarapQ9DCD6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GabarapQ9DCD6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GabarapQ9DCD6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GabarapQ9DCD6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GabarapQ9DCD6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GabarapQ9DCD6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GabarapQ9DCD6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GabarapQ9DCD6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GabarapQ9DCD6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GabarapQ9DCD6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms