Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms